Świadczone usługi:
Laboratorium Medycyny Regeneracyjnej Warszawskiego Uniwersytetu Medycznego w celach szczegółowych proponuje świadczenie szerokiego zakresu usług dla podmiotów zewnętrznych w ramach pracowni izolacji komórek, wizualizacji, biologii molekularnej, genomicznej oraz pracowni proteomicznej, tj.:
- oznaczenia fenotypowe populacji dojrzałych komórek pochodzących z krwi (ludzkiej, mysiej) oraz innych narządów (opcjonalnie)
- oznaczenia fenotypowe populacji komórek macierzystych i progenitorowych (materiał ludzki i zwierzęcy)
- oznaczenia fenotypowe komórek wywodzących się z ustalonych linii nowotworowych
- oznaczenia liczby komórek w fazie podziału o zdefiniowanym fenotypie (BrdU)
- analiza żywotności komórek (badanie apoptozy)
- badanie cyklu komórkowego
- sort różnych populacji komórek pochodzących z krwi o zdefiniowanym fenotypie
- sort komórek linii nowotworowych o zdefiniowanym fenotypie
- single-cell sort (sortowanie pojedynczej komórki)
- izolacja DNA/RNA
- klonowanie DNA
- analizy PCR i real-time PCR
- analiza ekspresji genów: miRNA, mRNA, siRNA
- genotypowanie
- walidacja procesów
- wykrywanie pozostałości DNA po bioprocesach
- potwierdzanie autentyczności linii komórkowych
- analiza SNP (Polimorfizm pojedynczego nukleotydu)
- analiza CNV (Warianty liczby kopii, ang. Copy Number Variation)
- usługi z zakresu projektowania starterów na potrzeby reakcji PCR, mutlipleks PCR, qPCR,
- HRM (High Resolution Melt), analizy STR (krótkie powtórzenia tandemowe, ang. short tandem repeats), VNTR (zmienna liczba powtórzeń tandemowych, ang. variable number of tandem repeats) i SNP (polimorfizm pojedynczego nukleotydu, ang. Single Nucleotide Polymorphism)
- identyfikacja pojedynczych białek
- identyfikacja zmian potranslacyjnych białek
- identyfikacja całych profili białkowych (poszczególnych organelli komórkowych, komórek w tym bakterii i grzybów, tkanek - zarówno zwierzęcych jak i roślinnych, płynów ustrojowych, mediów hodowlanych itp.)
- identyfikacja różnic w profilach białkowych pomiędzy różnymi próbami
- identyfikacja profilu lipidowego organelli komórkowych, komórek, tkanek, płynów
- ustrojowych itp.)
- identyfikacja różnic w lipidomie pomiędzy poszczególnymi próbami
- oznaczanie pełnego metabolomu
- oznaczanie ilościowe białek, lipidów, metabolitów substancji naturalnych lub leków, kwasów nukleinowych
- identyfikacja składu pierwiastkowego niezdefiniowanych wcześniej substancji
- oznaczanie kanabinoidów i innych substancji niedozwolonych (po uzyskaniu odpowiednich certyfikatów i zezwoleń)
- oznaczanie zawartości różnych zanieczyszczeń w wodzie oraz substancjach półstałych i stałych komercyjnie dostępnych.
- kontrola jakości składu produktów spożywczych (np. dla urzędów nadzorujących bezpieczeństwo żywności)
- kontrola składu (jakości) substancji chemicznych - proszki do prania, płyny do zmywania itp.
- sekwencjonowanie mRNA (mRNA-Seq)
- sekwencjonowanie wielu egzomów;
- sekwencjonowanie całego genomu
- kodowanie analizy transkrypcyjnej
- sekwencjonowanie transkryptomów
- sekwencjonowanie de novo, tj. szybkie i precyzyjne oznaczenie gatunków bez genomu referencyjnego
- metylacja DNA
- sekwencjonowanie Chip-Seq
- sekwencjonowanie małych RNA (microRNA, siRNA, piRNA i rRNA)
- profilowanie rybosomów
- sekwencjonowanie regionów zmiennych mikroorganizmów (metagenomika)
- mikromacierze cytogenetyczne
- genotypowanie poprzez sekwencjonowanie
- sekwencjonowanie wybranych fragmentów genomów i amplikonów
- resekwencjonowanie wybranych fragmentów genomu
- sekwencjonowanie małych genomów (bakterie, drożdże, wirusy)
- sekwencjonowanie małych niekodujących RNA (np. miRNA); small RNA-Seq umożliwia odkrycie nowych miRNA i innych małych niekodujących RNA, analizę różnic ekspresji wszystkich małych RNA w badanej próbce;
- profilowanie ekspresji genów (RNA-Seq)
- profilowanie nowotworów
- identyfikacja mutacji germinalnych
- badania związane z różnicowaniem komórek;
- pomiary indywidualnych reakcji komórek na konkretne bodźce;
- ocena biomarkerów chorób;
- walidacja metody RNAi;
- przygotowanie bibliotek miRNA;
- przygotowanie bibliotek cDNA przeznaczonych do Real-Time PCR
- immunofluorescencyjne barwienie preparatów komórek oraz tkanek
- barwienie preparatów komórek oraz tkanek standardową techniką H&E
- wykonanie wysokiej jakości zdjęć wybarwionych preparatów umożliwiających analizę jakościową oraz ilościową
- wykonanie obrazowania w czasie rzeczywistym hodowli komórkowej (wybarwionych barwnikami fluorescencyjnymi i/lub emitujących sygnał endogenny).