Pracownia proteomiki, metabolomiki i lipidomiki należąca do Laboratorium Medycyny Regeneracyjnej Centrum Badań Przedklinicznych Warszawskiego Uniwersytetu Medycznego wyposażona jest w najnowocześniejszy sprzęt do ilościowych i półilościowych analiz proteomicznych, metabolomicznych, w tym lipidomicznych. System spektrometrii mas składa się z dwóch spektrometrów mas sprzężonych z nano-UHPLC (nanoElute). Spektrometry mas wchodzące w skład systemu to:
1) SolariX 2xR (analizator cyklotronowego rezonansu jonów z fourierowską transformacją wyników, FT-ICR) wyposażony w dwa źródła jonizacji ESI (elektrorozpylanie) oraz MALDI (desorpcja laserowa z udziałem matrycy);
2) Compact (kwadrupol z analizatorem czasu przelotu) ze źródłem jonizacji ESI.
Będące na wyposażeniu spektrometry mas umożliwiają nam dostrzeżenie istotnych „ukrytych” informacji, których brakuje w danych z innych typów spektrometrów mas. Ta zaawansowana technologia jest odpowiedzią na potrzeby związane z pracą nad trudnym materiałem i jego bardzo małą ilością, zapewniając wydajne i precyzyjne rozwiązanie tego typu problemów analitycznych. Unikalną wartością tej technologii jest IFS (Isotopic Fine Structure), zapewniająca niezrównane zaufanie do identyfikacji związków, które wcześniej wymagały zgadywania.
Pracownia jest ponadto, wyposażona w specjalistyczne oprogramowanie bioinformatyczne, tj.:
- ProteinScape – do analiz proteomicznych
- Mascot Server – do identyfikacji polipeptydów i białek
- MetaboScape – do analiz metabolomicznych i lipidomicznych
- Tasq – do metabolomicznych i lipidomicznych analiz ilościowych
- BioTools – do analizy i intermpretacji widm MS oraz MS/MS
- GraphPad Prism – do analiz statystycznych
Dzięki wyposażeniu Pracowni proteomiki, metabolomiki i lipidomiki możemy dokonywać różnego rodzaju analiz, między innymi:
- Analiza półilościowa proteomiczna (całego profilu białkowego) typu „shotgun”
- Analiza półilościowa metabolomiczna (całego profilu związków małocząsteczkowych) typu „shotgun”
- Analiza półilościowa lipidomiczna (całego profilu lipidów, kwasów tłuszczowych itp.) typu „shotgun”
- Analiza ilościowa proteomiczna (poszczególnych polipeptydów)
- Analiza ilościowa metabolomiczna (poszczególnych związków małocząsteczkowych) typu „targeted metabolomics”
- Analiza ilościowa lipidomiczna (poszczególnych lipidów, kwasów tłuszczowych itp.) typu „targeted lipidomics”
- Wsparcie syntezy chemicznej, poprzez dokładną identyfikację poszczególnych składników syntetyzowanych substancji
- Kontrola sądowa i kontrola antydopingowa, różnego rodzaju substancji (w tym niedozwolonych)
- Metabolity leku, identyfikacja degradacji i zanieczyszczeń oraz oznaczanie ilościowe
- Wykrywanie i walidacja biomarkerów w proteomice, metabolomice i lipidomice
- Nienaruszona analiza białek (nietrawionych) i charakterystyka biofarmaceutyków
W sprawie analiz i usług świadczonych przez Laboratorium prosimy o kontakt z:
dr Diana Wierzbicka - diana.wierzbicka@wum.edu.pl
dr Kannathasan Thetchinamoorthy -
lub
Sekretariat Laboratorium Medycyny Regeneracyjnej – medycyna.regeneracyjna@wum.edu.pl
